由于冷凝水的产生和积聚，净化手术室空调机组容易成为细菌滋生的场所。因此，应重新分配系统的热湿负荷，使系统在潮湿条件下的运行点较小。本工程采用循环净化空调机组干工况运行系统。系统湿负荷均由新风机组承担，冷负荷由新风机组和各循环空调机组分担。
净化手术室系统具有以下运行特点：（1）新风集中处理，通过粗、中、亚三级过滤，满足进一步净化处理的要求，有利于保证手术室的清洁，提高工作效率末端过滤器的状况。（2） 循环机组承担部分冷负荷，减少新风负荷。（3） 经深度处理后，新风可抵消室内除湿，循环机组不需除湿，使盘管机组趋于干工况运行。（4） 湿度由新风机组机器的露点温度调节，再由回风量调节，不需再加热，避免了传统恒温恒湿处理方式中大量冷热的抵消，大大降低了系统的整体能耗。（5） 新风机组可用作系统值班机组，保持洁净手术室常年正压状态。（6） 各房间送风量便于独立控制和停机。